購買公務艇后，接下來就涉及到公務艇的管理，公務艇管理的內容繁雜，并非易事，縱觀海內外，公務艇的管理可以歸結為以下幾種方式：

第一、直接交給購船時的公務艇銷售公司來負責，很多船東之所以選擇這種方式是因為公務艇銷售公司具備專業的維護保養人員，這樣公務艇的維護和保養可以更為便捷，省心省力，但是這種方式避免不了會產生一種現象——道德風險和逆向選擇。

第二、雇傭業的船長和水手來管理，很多公務艇主認為公務艇的管理很簡單，一個船長、若干水手就完全可以應付自如，殊不知，公務艇管理需要專業的船長和水手來維護清潔，否則勢必出現重重問題，因小失大。

第三、交給俱樂部來管理，在國外，大部分公務艇都是交由游艇俱樂部來管理的，順應中國公務艇業的發展勢頭，游艇俱樂部也雨后春筍地出現，大多數也可以提供公務艇管理服務，但是從目前國內游艇俱樂部的現狀來看，管理方面并非他們的強項，而是更傾向于把精力放在泊位租賃、發展會員、游艇租賃和銷售，甚至游艇相關房地產的開發和銷售上面，難免顧此而失彼。

第四、交給專業的公務艇管理公司來負責，目前國內出現了一些公務艇管理公司，專業為客戶提供運輸、辦證、清潔、維護、保養服務，因為專業，所以安心。